共同完善国际证据基础
提交数据
PGT-mt图谱欢迎全球研究团队与诊所贡献数据。如果您开展过PGT-mt或研究过携带mtDNA变异的胚胎,您的结果能帮助更全面地描述该方法,包括未成功周期及未移植胚胎。
每一种结局都重要。未成功的结局也是数据。
为何每一种结局都重要
发表偏倚
PGT-mt成功结局比未成功结局更常发表。生育健康儿童的周期,比无合适胚胎、着床失败或妊娠丢失的周期更容易发表。
因此,文献可能呈现有偏图景,让人误以为几乎总能获得合适胚胎且结局可预测。未成功结局仍被低估,而家庭在遗传咨询中需要这些信息。
图谱同样认真记录全部结局。报告未成功结局有助于完善证据,提高准确性。
为何完整周期很重要
估计PGT-mt多大程度上能带来胚胎移植和活产,需要完整分母:周期内全部卵母细胞及胚胎,包括未移植者。周期可在下列任一阶段终止;每种结局都提供信息。
- 获取卵母细胞
- 成熟(MII)
- 受精(2PN)
- 囊胚
- 活检及PGT-mt
- 符合标准的胚胎
- 移植
- 妊娠
- 活产与随访
周期可能终止的阶段——每种结局都重要:
- 未成熟及退化卵母细胞
- 未受精卵母细胞
- 发育停滞
- 无检测结果
- 无符合标准胚胎
- 未着床
- 妊娠丢失
测量周期内全部胚胎的异质性,包括非整倍体、发育停滞及未移植胚胎,有助于描述mtDNA变异在卵子发生和早期发育中的传递。缺少这些观测,家庭风险估计便不完整。
欢迎提交的数据
研究与观测
- 完整PGT-mt周期:每个已启动周期,包括未移植即终止者。
- 每个胚胎的异质性数值,而非仅移植者;PGT-A及形态学结果。
- 对捐赠用于研究的胚胎开展的研究:滋养外胚层活检与内细胞团、剩余滋养外胚层的比较,重复活检,单个卵裂球。
- 卵母细胞与极体;携带者组织的异质性。
- 产前诊断及儿童出生后随访,注明组织、年龄和方法。
- 未成功及意外结局:无符合标准胚胎、着床失败、妊娠丢失,或胚胎与胎儿组织结果不一致。
- 方法学数据:验证、检出限、线性、全基因组扩增影响及重复测量。
- 图谱尚未纳入的已发表研究:提供文献及数值在文中的位置即可。
如何提交
提交步骤
联系数据库维护者
简述研究、数据集规模及发表状态。
填写模板
下载PGT-mt科研数据提交,填写适用工作表。推荐已发表研究时,请发送文献信息或DOI。
商定数据分享方式
数据库维护者将建议安全文件渠道。患者数据不得通过未加密邮件发送,不得上传至网站或GitHub。
科学审核
数据库维护者核查完整性、一致性、与已发表数据的重叠、授权、许可、去标识化及伦理要求;必要时联系作者澄清。
决定与署名
您将收到决定及理由。纳入数值将在图谱中注明来源和作者。
结构化科研数据模板
Excel模板
PGT-mt科研数据提交模板记录PGT-mt周期的最小数据集:患者及周期、胚胎、方法与结局,并设完整周期及未成功结局附加字段。关联工作表描述每个卵母细胞、胚胎、样本和结局,不含直接标识信息。
模板详情:工作表、填写说明与去标识化
模板工作表
| 研究 | 每项研究或数据集一行:数据生成者、地点及发表状态。26个字段,其中15个必填 |
|---|---|
| 周期 | 每个已启动IVF/PGT-mt周期一行,包括无合适胚胎或未移植周期。30个字段,其中18个必填 |
| 胚胎 | 每个胚胎或受检卵母细胞一行。包括周期全部胚胎,而非仅移植者。17个字段,其中7个必填 |
| 样本与测量 | 携带者组织、卵母细胞、极体、胚胎、产前及出生后样本每次测量一行。重复测量另起行。24个字段,其中9个必填 |
| 方法 | 每种测量所用分析方法或方案版本一行。22个字段,其中11个必填 |
| 临床结局 | 每种结局一行:无合适胚胎、着床失败、妊娠丢失、出生或随访。13个字段,其中3个必填 |
另含英俄双语说明、各字段定义、单位及允许值的数据字典,以及下拉选项。
零值、缺失数据与低于检出限的结果不同
- 空白单元格表示“未报告/未知”。
- 计数为0表示“已计数,数量为零”。
- 低于检出限是独立数值类型(below_lod),需注明检出限,不能填0。
- 已发表的区间或界限按原文保留,不以中点填补。
- 分析失败或未开展仍保留在表中,因为它属于周期记录。
不含直接标识信息
模板不设姓名、姓名首字母、出生或操作确切日期、地址、患者联系方式或病历号字段。年龄按组记录,时间为相对时间(胚胎天数、孕周、儿童月龄),全部编码均去标识化。
科学审核
从提交到纳入
所有提交均遵循相同审核流程。提交数据不会自动出现在公开图表中。纳入需数据库维护者单独决定,并通过审核后的数据集变更实现。
状态
- 已提交已登记询问或文件;不展示数据。
- 审核中核查完整性、一致性、重叠、授权与去标识化;问题转交作者。
- 已验证数据已通过审核,准备按证据级别纳入。
- 已纳入通过独立审核变更将数值加入数据集,并展示来源归属。
- 未接受数据未纳入;向作者说明理由,作者可提交修订版。
证据级别
每个数值旁始终显示来源与证据状态。不同类别不会在未明确标注的情况下合并。
- 经同行评审的文献
- 在科学期刊通过独立同行评审的结果。
- 已发表但未经独立同行评审
- 预印本、会议摘要、学位论文及报告。
- 未发表科研数据
- 研究团队与诊所分享给图谱、经审核的数据。
- 未经核实的报告
- 无法核实的信息,绝不绘于图表。
未发表数据另需
- 确认研究人员有权代表机构或数据所有者分享数据;
- 允许使用数据并公开展示去标识化数值(可设暂缓公开期);
- 核查去标识化:无直接或间接标识信息;
- 确认伦理要求:伦理委员会批准,以及患者同意将数据用于研究。
贡献认可
保留作者归属
- 每个纳入数值注明原始文献、作者及DOI;未发表数据注明提供数据的研究团队与机构。
- 贡献团队以其选择的形式获得图谱致谢。
- 图谱欢迎科研合作。有实质贡献的团队可受邀合作发表科学论文。
共同署名不会自动产生:每篇文献单独讨论,并按公认作者资格标准(ICMJE)确定。
联系数据库维护者
科研咨询
科研咨询、数据贡献或研究合作,请联系PGT-mt图谱创建与维护者Ilya Mazunin。
地址: ilya.mazunin@gmail.com
首封消息应包含什么
- 姓名、职务、机构及国家;
- 数据类型:已发表(DOI)或未发表;
- mtDNA变异及周期、胚胎、结局数量;
- 是否包含未成功结局及完整周期;
- 您偏好的安全数据文件分享方式。
主题
[PGT-mt图谱] PGT-mt数据贡献
初次咨询请勿附加患者医疗信息。数据文件仅在商定安全渠道后发送。