Вклад исследователей в доказательную базу
Поделиться данными
Атлас ПГТ-мт открыт для научного сотрудничества с исследовательскими группами и клиниками. Если вы проводили ПГТ-мт или исследовали эмбрионы с вариантами мтДНК, ваши результаты — в том числе неудачные циклы и неперенесённые эмбрионы — помогут получить более полную и честную картину возможностей метода.
Важен каждый исход. Отрицательный результат — тоже данные.
Почему важен каждый исход
смещение публикаций
Положительные результаты ПГТ-мт публикуются чаще отрицательных. Описание цикла, завершившегося рождением здорового ребёнка, имеет больше шансов попасть в журнал, чем цикл, в котором не нашлось ни одного пригодного эмбриона, перенос не привёл к имплантации или беременность прервалась.
В результате литература может давать смещённую оценку: казаться, что пригодный эмбрион находится почти всегда, а исход предсказуем. Частота неудач остаётся невидимой, хотя именно она нужна для консультирования семей.
Атлас собирает все исходы с одинаковым вниманием. Отрицательный результат не ослабляет доказательную базу — он делает её точнее.
Почему важны полные циклы
Чтобы оценить, как часто ПГТ-мт приводит к переносу и рождению ребёнка, нужен знаменатель: все ооциты и все эмбрионы цикла, а не только перенесённые. Каждый шаг ниже — место, где цикл может завершиться, и каждый такой исход — данные.
- ооциты получены
- зрелые (MII)
- оплодотворение (2PN)
- бластоцисты
- биопсия и ПГТ-мт
- пригодный эмбрион
- перенос
- беременность
- живорождение и наблюдение
Где цикл может завершиться — и всё это нужно учитывать:
- незрелые и дегенерировавшие ооциты
- неоплодотворившиеся ооциты
- остановка развития
- нет результата анализа
- нет пригодного эмбриона
- нет имплантации
- прервавшаяся беременность
Распределение гетероплазмии среди всех эмбрионов цикла, включая анеуплоидные, остановившиеся и неперенесённые, показывает, как вариант мтДНК передаётся в оогенезе и раннем развитии. Без них оценка риска для семьи неполна.
Какие данные нас интересуют
исследования и наблюдения
- Полные циклы ПГТ-мт — все начатые циклы, включая завершившиеся без переноса.
- Значения гетероплазмии по каждому эмбриону, а не только по перенесённым; результаты ПГТ-А и морфологии.
- Исследования эмбрионов, переданных для научных целей: сравнение биоптата трофэктодермы, внутренней клеточной массы и оставшейся трофэктодермы, повторные биопсии, отдельные бластомеры.
- Ооциты и полярные тельца, гетероплазмия в тканях носительницы.
- Пренатальная диагностика и постнатальное наблюдение детей с указанием ткани, возраста и метода.
- Отрицательные и неожиданные результаты: отсутствие пригодного эмбриона, отсутствие имплантации, потери беременности, расхождения между эмбрионом и тканями плода.
- Методические данные: валидация, предел обнаружения, линейность, влияние полногеномной амплификации, повторные измерения.
- Опубликованные работы, ещё не включённые в Атлас, — достаточно ссылки и указания, где в статье находятся значения.
Как предложить данные
шаг за шагом
Напишите куратору
Кратко опишите исследование, объём данных и статус публикации.
Заполните шаблон
Скачайте PGT-mt Research Data Submission и заполните листы, относящиеся к вашим данным. Опубликованную работу можно предложить и просто ссылкой.
Согласуйте способ передачи
Куратор предложит защищённый канал для файла. Данные пациентов не отправляются по незашифрованной почте и не загружаются на сайт или в GitHub.
Научная проверка
Куратор проверяет полноту, согласованность, пересечение с уже опубликованными данными, полномочия, разрешения, обезличивание и этические требования, при необходимости задаёт вопросы.
Решение и признание вклада
Вы получаете решение с обоснованием. Включённые значения появляются в Атласе с указанием источника и авторов.
Научный стандарт представления данных
шаблон Excel
Шаблон PGT-mt Research Data Submission описывает минимальный набор данных о цикле ПГТ-мт: пациентка и цикл, эмбрион, метод и исход — и дополняет его полями для полных циклов и отрицательных результатов. Связанные листы позволяют описать каждый ооцит, эмбрион, образец и исход без прямых идентификаторов.
Подробно о шаблоне: листы, правила заполнения, обезличивание
Листы шаблона
| StudyИсследование | Одна строка на исследование или набор данных: кто, где и в каком статусе публикации получил данные.26 полей, из них обязательных — 15 |
|---|---|
| CycleЦикл | Одна строка на начатый цикл ЭКО/ПГТ-мт — включая циклы, завершившиеся без пригодного эмбриона или без переноса.30 полей, из них обязательных — 18 |
| EmbryosЭмбрионы | Одна строка на эмбрион (или исследованный ооцит) — все эмбрионы цикла, а не только перенесённые.17 полей, из них обязательных — 7 |
| Samples_MeasurementsОбразцы и измерения | Одна строка на измерение: ткани носительницы, ооциты, полярные тельца, части эмбриона, пренатальные и постнатальные образцы. Повторы — отдельными строками.24 полей, из них обязательных — 9 |
| MethodsМетоды | Одна строка на аналитический метод или версию протокола, использованные в измерениях.22 полей, из них обязательных — 11 |
| Clinical_OutcomesКлинические исходы | Одна строка на событие: цикл без пригодного эмбриона, перенос без имплантации, потеря беременности, роды и каждый визит наблюдения.13 полей, из них обязательных — 3 |
Также: инструкция (EN/RU), словарь данных (Data Dictionary) с определениями, единицами и допустимыми значениями каждого поля и выпадающие списки.
Ноль, пропуск и предел обнаружения — разные значения
- Пустая ячейка — «не сообщается / неизвестно».
- 0 в счётчике — «посчитано, и таких нет».
- Ниже предела обнаружения — отдельный тип значения (below_lod) с указанием предела, а не 0.
- Опубликованный интервал или граница сохраняются как есть; середина не подставляется.
- Неудачный или непроведённый анализ остаётся в таблице — это тоже часть цикла.
Без прямых идентификаторов
В шаблоне нет полей для имён, инициалов, точных дат рождения и процедур, адресов, контактов пациентов и номеров медицинских карт. Возраст — группами, сроки — относительные (сутки эмбриона, неделя беременности, возраст ребёнка в месяцах), коды — обезличенные.
Научная проверка
путь данных
Каждое предложение проходит одни и те же статусы. Ничто из поступивших материалов не попадает в публичные графики автоматически: включение — отдельное решение куратора, оформляемое как проверенное изменение набора данных.
Статусы
- ПолученоОбращение или файл зарегистрированы; данные не показываются.
- На проверкеПолнота, согласованность, пересечение с опубликованными данными, полномочия и обезличивание; вопросы к авторам.
- ПровереноДанные прошли проверку и подготовлены к включению с указанием уровня доказательности.
- ВключеноЗначения добавлены в набор данных отдельным проверенным изменением и показываются с указанием источников и авторов.
- ОтклоненоДанные не включены; авторы получают обоснование и могут предложить исправленную версию.
Уровни доказательности
Происхождение данных остаётся видимым рядом с каждым значением. Уровни не смешиваются без явной пометки.
- Рецензированные публикации
- Результаты, прошедшие независимое рецензирование в научном журнале.
- Опубликовано без независимого рецензирования
- Препринты, тезисы конференций, диссертации, отчёты.
- Неопубликованные исследовательские данные
- Данные исследовательских групп и клиник, переданные в Атлас после проверки.
- Непроверенные сообщения
- Сведения, которые не удалось проверить. В графиках не показываются.
Для неопубликованных данных дополнительно требуется
- подтверждение полномочий исследователя передавать данные от имени организации или владельца данных;
- разрешение на использование и на публичный показ обезличенных значений (с возможным эмбарго);
- проверка обезличивания: отсутствие прямых и косвенных идентификаторов;
- подтверждение этических требований: одобрение этического комитета и согласие пациентов на использование данных в исследованиях.
Правовые основания использования данных
Предоставленные исследовательские материалы рассматриваются куратором с учётом применимых требований законодательства Российской Федерации в части получения, обработки, обезличивания и публичного распространения данных. Само по себе обезличивание не отменяет иных законодательных ограничений, если они распространяются на конкретные материалы.
При наличии соответствующих правовых оснований и в пределах применимости учитываются статьи 3, 6 и 10 Федерального закона от 27.07.2006 № 152-ФЗ «О персональных данных», статья 13 Федерального закона от 21.11.2011 № 323-ФЗ «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации», а также статьи 13.1 и 13.2 Федерального закона от 05.07.1996 № 86-ФЗ «О государственном регулировании в области генно-инженерной деятельности» в редакции Федерального закона от 20.02.2026 № 43-ФЗ. В предусмотренных законом случаях также учитываются постановление Правительства РФ от 15.06.2026 № 750 и требования к обезличиванию персональных данных, утверждённые приказом Роскомнадзора от 19.06.2025 № 140.
Признание вклада
авторство сохраняется
- У каждого включённого значения указаны первичная публикация, её авторы и DOI — или исследовательская группа и организация, передавшие неопубликованные данные.
- Группы, передавшие данные, указываются в Атласе в выбранной ими форме.
- Атлас приглашает к научному сотрудничеству. Группы, внёсшие существенный вклад, могут быть приглашены к совместным научным публикациям.
Соавторство не предоставляется автоматически: оно обсуждается для каждой публикации отдельно и определяется по общепринятым критериям авторства (ICMJE).
Связаться с куратором
научные обращения
Научные вопросы, предложения данных и сотрудничества направляются куратору Атласа ПГТ-мт Илье Мазунину.
Адрес: ilya.mazunin@gmail.com
Что указать в первом обращении
- ваше имя, должность, организацию и страну;
- тип данных: опубликованные (DOI) или неопубликованные;
- вариант(ы) мтДНК, число циклов, эмбрионов и исходов;
- есть ли отрицательные исходы и полные циклы;
- какой способ передачи файла для вас допустим.
Тема письма
[Атлас ПГТ-мт] Предложение данных ПГТ-мт
Не прикладывайте к обращению медицинские сведения о пациентах. Файлы с данными передаются только после согласования защищённого канала.