Методы и ограничения
Что собрано
Значения гетероплазмии извлечены из первичных публикаций для эмбрионов, по которым опубликованы индивидуальные значения. В текущей версии: 187 значений для 7 вариантов мтДНК; 40 бластоцист с измерениями нескольких частей (биоптат ТЭ, ВКМ, оставшаяся ТЭ или объединённая часть ВКМ+ТЭ); постимплантационные данные 16 плодов и детей, для которых известен уровень в перенесённом эмбрионе. Значения берутся из первичных публикаций; обзоры использованы только там, где оригинал недоступен, и это отмечено.
Публикации не всегда приводят значения для всех эмбрионов цикла, поэтому набор не равен полному числу эмбрионов в циклах. По объединённым случаям из разных публикаций нельзя рассчитать частоту клинического успеха ПГТ-мт.
32 записи, из них 30 точные пары у 16 плодов и детей. 22 публикации, из них 12 — со значениями по эмбрионам.
Объём данных
| Показатель | Количество |
|---|---|
| значения гетероплазмии эмбрионов | 187 |
| варианты мтДНК в распределении гетероплазмии | 7 |
| бластоцисты с измерениями нескольких частей | 40 |
| записи по частям бластоцист | 91 |
| эмбрионы стадии дробления (два бластомера) | 22 |
| записи «эмбрион → потомство» | 32 |
| дети в записях «эмбрион → потомство» | 17 |
| дети с точной парой «перенесённый эмбрион — ткань» | 16 |
| публикации | 22 |
Как представлены значения
- «0» означает, что вариант не выявлен использованным методом, а не доказанный молекулярный ноль. Предел обнаружения показывается, только если он указан в источнике.
- Если опубликован только интервал, хранятся его границы; середина не подставляется.
- Каждое значение помечено способом получения. Пометка ставится, только если правило записано по исходной таблице Атласа:
- Способ получения не указан — 137 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
- Среднее бластомеров и ТЭ — 1 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
- Среднее двух бластомеров — 19 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
- Среднее двух половин эмбриона — 9 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
- Среднее нескольких биоптатов — 11 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
- Снято с рисунка первоисточника — 9 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
- Взято из обзоров (первоисточник — тезисы) — 1 значений в разделе «Между разными эмбрионами»
Каждая точка на графиках ведёт к источнику значения и к публикации (DOI).
Ориентиры на графиках
- 18% · оценка риска в конкретном исследовании — Расчётный ориентир систематического обзора: уровень мутации ≤18% в мышечной ткани связан с вероятностью ≥95% остаться непоражённым (159 точковых вариантов мтДНК; семейные данные 137 родословных; априорная доля поражённых 0,477). Для m.3243A>G вероятность остаться непоражённым ниже. Оценка получена не на эмбрионах и не является порогом для биоптата эмбриона. (Hellebrekers et al., 2012 doi:10.1093/humupd/dms008)
Hum Reprod Update 2012;18(4):341–349, абстракт (PubMed 22456975), раздел Results. Проверено: 2026-10-11 по абстракту PubMed. Полного текста нет ни в репозитории, ни в PMC: состав выборки и исключения сверены только в объёме абстракта. - 15–30% · диапазон, приводимый в литературе — Диапазон симптоматического порога m.3243A>G, который Ji и соавт. приводят как общепринятый со ссылкой на литературу; собственный порог для m.3243A>G по своим данным авторы определить не смогли. (Ji et al., 2023 doi:10.1007/s10815-023-02880-2)
J Assist Reprod Genet 2023;40:2185–2196, с. 2190 (Results) и с. 2193 (Discussion); у авторов — ссылка [23]. Проверено: 2026-10-11 по PDF (references/Ji et al 2023 PGTmt risk and chance.pdf) - 30% · рабочий критерий клинической программы — Рабочий критерий программы Newcastle: для переноса или витрификации преимущественно использовали эмбрионы с гетероплазмией менее 30%, измеренной в одном бластомере 3-го дня. Это критерий конкретной клинической программы, а не универсальная граница. (Hyslop et al., 2025 doi:10.1056/NEJMoa2415539)
N Engl J Med 2025, Methods (с. 3 PDF: «single blastomere was removed on day 3»; «less than 30% heteroplasmy») и с. 5 PDF. Проверено: 2026-10-11 по PDF (references/Hyslop et al 2025 MRT PGTmt.pdf)
Ни одно из этих чисел не задаёт безопасного порога для отдельного эмбриона. Три числа, которыми пользуются на практике (18, 15–30 и 30%), отвечают на разные вопросы и получены на разных тканях, методах и исходах.
Ограничения
- Набор описательный и не позволяет провести мета-анализ: исследования различаются по стадии биопсии, методам измерения и пределам обнаружения.
- Удачные циклы публикуются чаще неудачных; данных для коррекции этого смещения нет.
- Эмбрионы не являются независимыми наблюдениями: многие получены от одной пациентки в одном цикле; варианты представлены неравномерно. Объединённая доля не является индивидуальным риском.
- В сопоставлениях «эмбрион — ребёнок» часть измерений относится к одному ребёнку (разные ткани, сроки, методы, лаборатории).
- Совместная модель ПГТ-мт и ПГТ-А — сценарный расчёт: она не учитывает внутрисемейную корреляцию и не даёт индивидуального прогноза.
Классификация вариантов
Класс варианта указан по первичной публикации; Атлас не вводит собственный классификатор, в том числе по уровню гетероплазмии. Для каждого варианта указано, на каком утверждении первичной публикации основан класс, и дата проверки. Сверка с базами MITOMAP и ClinVar при этой проверке не выполнялась.
| Вариант | Класс | Основание |
|---|---|---|
| HV2 polymorphism | Нейтральный полиморфизм | по сопроводительной таблице; явного утверждения в первичной публикации не найдено (проверено 2026-10-11) |
| m.10158T>C | Патогенный вариант | основание: Hyslop et al., 2025, Table 1, Maternal Pathogenic Variant Heteroplasmy in Infants; PGT; проверено 2026-10-11 |
| m.10191T>C | Патогенный вариант | по сопроводительной таблице; явного утверждения в первичной публикации не найдено (проверено 2026-10-11) |
| m.10197G>A | Патогенный вариант | основание: Mizuguchi et al., 2025, PDF с. 1: «The m.10197G>A mutation… is a rare pathogenic mutation of Leigh encephalopathy»; проверено 2026-10-11 |
| m.13094T>C | Патогенный вариант | основание: Hyslop et al., 2025, Table 1, Maternal Pathogenic Variant Heteroplasmy in Infants; PGT; проверено 2026-10-11 |
| m.14487T>C | Патогенный вариант | основание: Tofilo et al., 2026, Tofilo et al., 2026, основной текст, Introduction — pathogenic mtDNA variant m.14487T>C; doi:10.1007/s10815-026-04012-y, PMID 42649365.; проверено 2026-10-11 |
| m.3243A>G | Патогенный вариант | основание: Spath et al., 2021, PDF с. 8: «Unlike many other pathogenic mtDNA mutations, m.3243A>G heteroplasmy levels are poorly predictive…»; проверено 2026-10-11 |
| m.3250T>C | Вариант неопределённого значения | основание: Hu et al., 2026, PDF с. 3: «the variant is annotated as a variant of uncertain significance (VUS) due to incomplete penetrance and likely benign in silico predictions» (у авторов — ссылки на MITOMAP и Wong et al.); проверено 2026-10-11 |
| m.3697G>A | Патогенный вариант | косвенно: Ji et al., 2021, PDF с. 7: «the inheritance of different pathogenic mtDNA mutations… previous analysis has not included m.3697G>A»; проверено 2026-10-11 |
| m.8344A>G | Патогенный вариант | по сопроводительной таблице; явного утверждения в первичной публикации не найдено (проверено 2026-10-11) |
| m.8993T>C | Патогенный вариант | основание: Hyslop et al., 2025, Table 1, Maternal Pathogenic Variant Heteroplasmy in Infants; PGT; проверено 2026-10-11 |
| m.8993T>G | Патогенный вариант | косвенно: Spath et al., 2021, PDF с. 9: «clear differences in transmission patterns between pathogenic mutations… m.8993T>G…»; проверено 2026-10-11 |
Что публиковать о цикле ПГТ-мт
- Пациентка и цикл: возраст; семейный анамнез; гетероплазмия в тканях носительницы; число ооцитов; оплодотворение и развитие эмбрионов.
- Эмбрион: день биопсии; морфология; результат ПГТ-А; гетероплазмия в каждом образце — по каждому эмбриону, включая не перенесённые.
- Метод: полногеномная амплификация; анализируемый участок; линейность; предел обнаружения; контроли.
- Исход: пренатальная диагностика и постнатальное наблюдение с указанием ткани, возраста и метода.