第2章 · PGT-mt基础知识
异质性与阈值效应
异质性测量取决于组织、取样时间及分析方法。异质性水平与临床结局的关系呈非线性,并因变异而异。
基础
究竟测量什么
异质性水平是采用特定方法,在特定样本中测得的某位点携带变异mtDNA分子的百分比。这三个限定均重要。同一人的血液、尿液、口腔黏膜细胞及肌肉数值可不同(Stewart & Chinnery, 2015; Burr & Chinnery, 2024);不同方法对同一组织也可给出不同结果(Treff et al., 2012; Mitalipov et al., 2014)。
不同组织,不同水平
细胞分裂时,mtDNA分子在子细胞间分配不均,不同细胞类型对其选择方向或强度也可不同。因此各组织的异质性水平可随时间逐渐不同,称为体细胞分离。m.3243A>G在血细胞中随年龄呈指数下降,而骨骼肌等组织并非如此(Burr & Chinnery, 2024)。母亲血液水平不决定卵母细胞水平。
阈值效应
异质性较低时,不携带致病性变异的mtDNA拷贝常能维持足够线粒体功能,避免出现可测得的生化缺陷。携带变异比例增加并超过某阈值后,生化缺陷可能显现;异质性与功能并非线性关系(Rossignol et al., 2003)。这就是阈值效应。阈值取决于变异、组织、呼吸链复合体、mtDNA拷贝数及核背景(Rossignol et al., 2003; Burr & Chinnery, 2024)。下图展示概念,并非真实数值。
三个效应层次
- 分子层面
- 所研究样本中携带特定突变mtDNA的比例。
- 生化层面
- 细胞或组织中的呼吸链复合体活性及ATP合成。
- 临床层面
- 症状、严重程度及发病年龄。
这些层次并非简单一一对应。相同血液异质性水平可对应不同疾病严重程度,因为临床上重要的是受累组织——脑、肌肉、心脏、视网膜——中的负荷,而这些组织通常不便取样检测(Gorman et al., 2016; Burr & Chinnery, 2024)。
不存在通用安全水平
PGT-mt文献中的18%、30%等数值针对不同问题,来自不同数据(Hellebrekers et al., 2012; Hyslop et al., 2025)。它们均不保证儿童健康,也不能自动应用于所有变异。第6章详细讨论这些参考值。
用于选择移植胚胎的异质性界值需针对特定变异确定并说明依据,不能作为固定标准套用。
进阶
形式定义与测量伪差
对于从样本提取的mtDNA的特定位点,异质性水平h = n(致病性变异) / [n(致病性变异) + n(野生型)]。该值表征样本分子群体,不能据此重建单个细胞的异质性。获得报告结果涉及细胞选择、裂解、必要时全基因组扩增、含变异区域扩增、检测及校准。各步均可能引入偏倚(Mavraki et al., 2023; Spath et al., 2021)。
体细胞分离与组织差异
mtDNA复制不依赖细胞周期,分裂时随机分配至子细胞。因此后续细胞世代的突变mtDNA比例可经随机分离升高或降低(Chinnery et al., 2000; Stewart & Chinnery, 2015; Mavraki et al., 2023)。此外还有细胞类型特异选择:快速更新的组织与不再分裂的细胞表现不同,有助于解释mtDNA疾病的组织特异性(Burr & Chinnery, 2024)。m.3243A>G的血液异质性随年龄呈指数下降,骨骼肌则不如此(Burr & Chinnery, 2024)。细胞间嵌合可在胚胎很早期出现。某些变异在第3天单个卵裂球中已显示mtDNA差异,且可持续至后续阶段(Mertens et al., 2022)。
组织、生化与变异特异阈值
Rossignol等表明,生化阈值因呼吸链复合体及组织而异,功能与突变mtDNA比例呈非线性关系(Rossignol et al., 2003)。常引用的60–80%是综述给出的概括范围(Xie et al., 2026),描述特定组织的异质性–功能关系,并非胚胎筛选标准。
变异特异性也见于临床数据。Hellebrekers等根据137个家系计算,肌肉突变水平≤18%对应至少95%的不发病概率;m.3243A>G的该概率显著更低(p < 0.001)(Hellebrekers et al., 2012)。Ji等分别估计不同变异的症状阈值(Ji et al., 2023)。生殖系中,不同mtDNA突变可产生不同数量的可移植胚胎:m.3243A>G携带者无极高负荷卵母细胞或胚胎,而m.8993T>G数值多为极端值,家系数据中后代水平更常高于母亲(Otten et al., 2018)。
测量方法与分析误差
异质性定量采用聚合酶链反应(PCR)联合限制性分析、焦磷酸测序、等位基因特异性定量PCR(ARMS-qPCR)、微滴数字PCR(ddPCR),以及靶向或全基因组测序(Rubens et al., 2025; Mizuguchi et al., 2025; Mitalipov et al., 2014; Tytgat et al., 2021; Spath et al., 2021; Janssen et al., 2024)。各方法的检出限、0–100%全范围内的线性、可重复性及对扩增偏倚的敏感程度不同。性能由特定实验室验证确定,而非由技术名称决定(Mavraki et al., 2023)。
分析误差可与所解读差异的幅度相当。Tajima等报告其方法误差为−5至+6个百分点(Tajima et al., 2007)。一例已发表m.3243A>G病例说明:移植12%异质性囊胚后,儿童1月龄口腔细胞为15%;商业实验室报告5及12月龄血液低于10%;6周及18月龄ARMS-qPCR复测血液为47%、46%,尿液为52%、42%(Treff et al., 2012; Mitalipov et al., 2014)。这些数据发表于Mitalipov等对Steffann等的回复(Mitalipov et al., 2014; Steffann et al., 2014)。取样年龄及检测方法均不同,不能将差异仅归因于方法。
异质性结果必须结合样本、分析方法及检出限解读。阈值取决于变异、组织及该数值所回答的问题。
图解与模型
阈值效应
从概念到图谱数据
- 单个胚胎内部 →
同一胚胎不同样本的异质性水平一致性。灰色±5个百分点色带为示意参考,并非经验证的分析不确定度估计。
- 胚胎、胎儿与儿童 →
胚胎异质性与胎儿、儿童组织水平如何比较,以及样本类型、年龄和方法如何影响比较。
- 方法与局限 →
图谱如何处理检出限、区间及从图中数字化获取的数值。
本章参考文献 (21)
全部DOI已与PubMed核对;例外在条目旁标注。
- (2015). The dynamics of mitochondrial DNA heteroplasmy: implications for human health and disease. Nat Rev Genet 16:530–542. doi:10.1038/nrg3966 · PMID 26281784
- (2024). Origins of tissue and cell-type specificity in mitochondrial DNA (mtDNA) disease. Hum Mol Genet 33(R1):R3–R11. doi:10.1093/hmg/ddae059 · PMID 38779777
- (2012). Blastocyst preimplantation genetic diagnosis (PGD) of a mitochondrial DNA disorder. Fertil Steril 98:1236–1240. doi:10.1016/j.fertnstert.2012.07.1119 · PMID 22921075
- (2014). Limitations of preimplantation genetic diagnosis for mitochondrial DNA diseases. Cell Rep 7:935–937. doi:10.1016/j.celrep.2014.05.004 · PMID 24856294
- (2003). Mitochondrial threshold effects. Biochem J 370:751–762. doi:10.1042/BJ20021594 · PMID 12467494
- (2016). Mitochondrial diseases. Nat Rev Dis Primers 2:16080. doi:10.1038/nrdp.2016.80 · PMID 27775730
- (2012). PGD and heteroplasmic mitochondrial DNA point mutations: a systematic review estimating the chance of healthy offspring. Hum Reprod Update 18:341–349. doi:10.1093/humupd/dms008 · PMID 22456975
- (2025). Mitochondrial donation and preimplantation genetic testing for mtDNA disease. N Engl J Med 393:438–449. doi:10.1056/NEJMoa2415539 · PMID 40673696
- (2023). Genetic testing for mitochondrial disease: the United Kingdom best practice guidelines. Eur J Hum Genet 31:148–163. doi:10.1038/s41431-022-01249-w · PMID 36513735
- (2021). Clinical application of sequencing-based methods for parallel preimplantation genetic testing for mitochondrial DNA disease and aneuploidy. Fertil Steril 115:1521–1532. doi:10.1016/j.fertnstert.2021.01.026 · PMID 33745725
- (2000). The inheritance of mitochondrial DNA heteroplasmy: random drift, selection or both?. Trends Genet 16:500–505. doi:10.1016/S0168-9525(00)02120-X · PMID 11074292
- (2022). Mitochondrial DNA variants segregate during human preimplantation development into genetically different cell lineages that are maintained postnatally. Hum Mol Genet 31:3629–3642. doi:10.1093/hmg/ddac059 · PMID 35285472
- (2026). Inheritance and selection of the mitochondrial genome. Nat Rev Genet (online ahead of print). doi:10.1038/s41576-026-01019-0 · PMID 42834120
- (2023). Modeling-based prediction tools for preimplantation genetic testing of mitochondrial DNA diseases: estimating symptomatic thresholds, risk, and chance of success. J Assist Reprod Genet 40:2185–2196. doi:10.1007/s10815-023-02880-2 · PMID 37439868
- (2018). Mutation-specific effects in germline transmission of pathogenic mtDNA variants. Hum Reprod 33:1331–1341. doi:10.1093/humrep/dey114 · PMID 29850888
- (2025). Profiling mitochondrial DNA variant segregation during human preimplantation development: a prerequisite to preimplantation genetic testing for mitochondrial DNA-related disorders. Hum Reprod 40:956–961. doi:10.1093/humrep/deaf050 · PMID 40174913
- (2025). Successful birth after preimplantation genetic testing for rare mitochondrial DNA mutation m.10197G>A. Hum Genome Var 12:7. doi:10.1038/s41439-025-00311-5 · PMID 40164591
- (2021). Digital polymerase chain reaction for assessment of mutant mitochondrial carry-over after nuclear transfer for in vitro fertilization. Clin Chem 67:968–976. doi:10.1093/clinchem/hvab021 · PMID 33822904
- (2024). Clinical-grade whole genome sequencing-based haplarithmisis enables all forms of preimplantation genetic testing. Nat Commun 15:7164. doi:10.1038/s41467-024-51508-1 · PMID 39223156
- (2007). The development of novel quantification assay for mitochondrial DNA heteroplasmy aimed at preimplantation genetic diagnosis of Leigh encephalopathy. J Assist Reprod Genet 24:227–232. doi:10.1007/s10815-007-9114-0 · PMID 17342424
- (2014). Data from artificial models of mitochondrial DNA disorders are not always applicable to humans. Cell Rep 7:933–934. doi:10.1016/j.celrep.2014.05.005 · PMID 24856293