第1章 · PGT-mt基础知识

线粒体DNA与母系遗传

线粒体具有自身的环状DNA——线粒体DNA(mtDNA)。许多细胞含数百至数千个此类分子,数量取决于细胞类型。人类仅从母亲继承mtDNA:女性可将其传递给所有子女,男性不向子女传递。致病性变异(突变)可能仅存在于细胞内部分mtDNA分子中,第2章将解释这一点。这些特征使mtDNA相关疾病不遵循孟德尔遗传规律。

阅读层次

基础

线粒体内的基因组

人类大多数基因位于细胞核。每个核基因通常有两份拷贝,分别来自父母。线粒体具有自身DNA,并帮助细胞供能。人类mtDNA呈环状,约含16,600个碱基对(Anderson et al., 1981; Andrews et al., 1999)。尽管很小,它编码参与细胞供能的一些关键蛋白(Chinnery et al., 2000)。

核基因也编码线粒体功能所需蛋白。线粒体功能障碍导致的疾病可涉及核DNA或mtDNA突变。核DNA突变的遗传通常用经典遗传学描述,而mtDNA突变需要采用不同的分析方法(Ng et al., 2021)。

数百至数千份拷贝,而非两份

细胞含数百至数千份mtDNA拷贝,而非两份,数量随细胞类型而变:精子中数十份,成熟卵母细胞中数十万至逾百万份。一项研究测得三名健康供者卵母细胞平均约含120万个分子(Xie et al., 2026; Floros et al., 2018)。mtDNA拷贝数随组织、发育阶段而变,也部分取决于核遗传背景(Gupta et al., 2023)。

经母亲遗传

人类mtDNA经卵母细胞沿母系传递(Chinnery et al., 2000; Xie et al., 2026)。这带来一些简单而重要的遗传特点:携带mtDNA致病性变异的男性不会将其传给子女;女性可传给所有子女,不分性别,但只有女儿能继续传给下一代(Mavraki et al., 2023)。

同质性与异质性

细胞内全部mtDNA拷贝在所考察位点具有相同序列,称为同质性。不同类型mtDNA在细胞内共存,例如部分携带某变异、部分不携带,称为异质性。携带变异的比例称为异质性水平,也称突变负荷,以百分比表示(Stewart & Chinnery, 2015)。下方“细胞中的异质性”模型展示20%或80%的实际含义。

PGT-mt评估的大多数致病性变异呈异质性状态:携带及不携带变异的拷贝共存于同一细胞,包括卵母细胞。儿童可能同时继承这两类mtDNA拷贝。结局可从不发病到严重疾病,取决于变异及其异质性水平(Chinnery et al., 2000)。

这与核DNA基因遗传有何不同?

  • 核DNA突变:一个基因通常有两份拷贝,分别来自父母。突变可发生在母源、父源或两份拷贝中;遗传遵循经典孟德尔模式。
  • 线粒体DNA突变:沿母系遗传。每个细胞含多个mtDNA分子,携带突变的比例可从零至100%。无法预先预测某个卵母细胞的确切比例(Smeets et al., 2023)。

线粒体病的遗传学

线粒体病的表现及发病年龄差异很大。有时mtDNA突变不引起临床症状(Gorman et al., 2016)。约每200人中1人携带mtDNA致病性变异,通常水平较低;mtDNA疾病约影响每5,000–10,000人中的1人(Xie et al., 2026)。大多数携带者水平低于出现临床表现的阈值(第2章)。成年人约1/5,000的估计包含患者及有mtDNA疾病风险的携带者(Gorman et al., 2015)。mtDNA突变可新发,也可来自母亲。新发突变的再发风险通常较低,但不能完全排除其他卵母细胞也携带的可能(Smeets et al., 2023)。

PGT-mt测量从胚胎取得的少量活检样本中携带突变的mtDNA比例。该比例用于移植胚胎选择时的定量评估;基础课程将对此解释。

进阶

基因组结构

人类mtDNA参考序列(修订版剑桥参考序列,rCRS)长16,569 bp(Anderson et al., 1981; Andrews et al., 1999)。基因排列紧密,基因间碱基很少或没有;某些终止密码子未完整编码于DNA中,转录后经多聚腺苷酸化补全(Anderson et al., 1981)。主要非编码区约1 kb,含D环,具有调控复制与转录的元件(Chinnery et al., 2000)。其高变区如HV2具有多态性,可作为胚胎mtDNA分离研究的中性标记(Rubens et al., 2025)。

mtDNA编码的13种蛋白是呼吸链复合体I、III、IV、V的亚基;复合体II完全由核基因编码(Gorman et al., 2016)。变异按参考序列位置命名:m.3243A>G表示第3243位腺嘌呤被鸟嘌呤替代。图谱栏目中的变异位于tRNA基因(MT-TL1:m.3243A>G、m.3250T>C;MT-TK:m.8344A>G)及蛋白编码基因(MT-ATP6:m.8993T>G/C;MT-ND1:m.3697G>A;MT-ND3:m.10191T>C、m.10197G>A;MT-ND6:m.14487T>C)。

mtDNA拷贝数:数量而非常数

mtDNA拷贝数在组织与个体间不同,并与核基因组变异相关:人群规模分析发现与拷贝数及异质性均相关的核基因座(Gupta et al., 2023)。Floros等测得三名健康供者卵母细胞平均含1.22×10⁶个mtDNA分子;人胚Carnegie CS12阶段原始生殖细胞约少1,000倍(每细胞中位数1,425、均值1,446份);线粒体数量几乎不变,约每个细胞器五个分子(Floros et al., 2018)。小鼠、牛及斑马鱼也有类似生殖系拷贝数减少,具有进化保守性(Xie et al., 2026)。早期胚胎在囊胚阶段前mtDNA复制大体受抑,已有分子分配到不断增加的细胞中(Rubens et al., 2025; Facucho-Oliveira & St John, 2009)。

拷贝数与异质性是不同量。拷贝数描述mtDNA有多少,异质性描述各mtDNA变异的相对比例。

母系遗传

严格母系传递是人类及大多数动物的规律。Luo等报告三个家庭存在双亲遗传(Luo et al., 2018)。这些观测的解释仍有讨论,包括核基因组中mtDNA片段拷贝(NUMTs)的作用;阻止父系传递的机制仍在研究(Xie et al., 2026)。母系传递意味着mtDNA不与父源拷贝重组,以单一单倍型传递;新变异可来自复制错误、单链mtDNA损伤及氧化过程(Iliushchenko et al., 2025)。这些错误或由修复机制纠正,或跨代传播(Stewart & Chinnery, 2015)。mtDNA碱基替换的积累速度比核基因快10–20倍(Xie et al., 2026; Bi et al., 2023),但女性生殖系似乎受到保护:与血液及唾液不同,卵母细胞新突变频率未随年龄增加(Arbeithuber et al., 2025)。生殖系选择见第3章。

异质性:实践中重要的定义

异质性水平
分析样本中某位点携带变异分子占全部mtDNA分子的比例。它是样本全部细胞的平均值:多细胞活检样本会将异质性水平不同的细胞合并测量。
同质性
全部mtDNA拷贝在所考察位点序列相同。
细胞间嵌合
同一组织不同细胞的水平差异。即使第3天胚胎,单个卵裂球也可能携带邻近细胞未检出的变异(Mertens et al., 2022)。但该研究涉及无已知致病突变的供者胚胎中的自然变异,多为低水平。对于携带者的致病性变异,同一胚胎各卵裂球的异质性水平通常相近(第4章)(Mertens et al., 2022; Monnot et al., 2011)。
低水平异质性
低于常规方法检出限的罕见变异广泛存在,包括健康女性卵母细胞中(Bi et al., 2023)。

线粒体病的遗传特点

  • 变异类型。mtDNA致病性变异通常呈异质性状态,也可呈同质性状态。PGT-mt适用于异质性:若全部卵母细胞变异比例相同,便无较低水平胚胎可选,需考虑其他生育方案(Smeets et al., 2023; Castelluccio et al., 2025)。
  • 来源。后续子女疾病再发概率直接取决于突变来源:新发变异在后续同胞中再次导致疾病的风险较低,但不能完全排除其他母源卵母细胞也携带。若由母亲遗传,再发风险较大,却因瓶颈效应而无法预测单次妊娠(第3章)(Smeets et al., 2023)。因此讨论PGT-mt前,应研究母亲组织,并尽可能研究其他母系亲属组织(Mavraki et al., 2023)。
  • 外显不全与表现度可变。同一变异可在不同携带者中引起不同综合征,从单一症状到严重多系统疾病;严重程度取决于特定组织突变负荷。例如m.8993T>G的临床表现随异质性水平不同(Gorman et al., 2016; Burr & Chinnery, 2024; Xie et al., 2026)。
  • 核基因。核基因引起的线粒体病遵循孟德尔遗传,采用PGT-M而非PGT-mt(Smeets et al., 2023)。

考虑妊娠的女性已确认以异质性状态携带特定mtDNA致病性变异时,PGT-mt适用;最好在多种组织中得到确认。

图解与模型

交互图解

细胞中的异质性

30%

100个mtDNA分子中,30个携带致病性变异

异质性:两种mtDNA共存于细胞内

  • 野生型mtDNA
  • 携带致病性变异的mtDNA

含细胞核及五个线粒体的细胞;圆环为mtDNA分子。

本图用于解释异质性,并非疾病发生模型。真实细胞含数百至数千份mtDNA,此处显示100份。样本测量值是多个细胞的平均值,这些细胞的异质性水平可能不同。功能影响取决于变异及组织(第2章)。

从概念到图谱数据

  • 不同胚胎之间 →

    数据集所含七种mtDNA变异的已发表胚胎异质性数值:治疗周期中已发表数值的分布。

  • 数据来源 →

    图谱数值所依据的原始文献、作者及DOI。

本章参考文献 (22)

全部DOI已与PubMed核对;例外在条目旁标注。

  1. Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, et al. (1981). Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nature 290:457–465. doi:10.1038/290457a0 · PMID 7219534
  2. Andrews RM, Kubacka I, Chinnery PF, et al. (1999). Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA. Nat Genet 23:147. doi:10.1038/13779 · PMID 10508508
  3. Chinnery PF, Thorburn DR, Samuels DC, et al. (2000). The inheritance of mitochondrial DNA heteroplasmy: random drift, selection or both?. Trends Genet 16:500–505. doi:10.1016/S0168-9525(00)02120-X · PMID 11074292
  4. Ng YS, Bindoff LA, Gorman GS, et al. (2021). Mitochondrial disease in adults: recent advances and future promise. Lancet Neurol 20:573–584. doi:10.1016/S1474-4422(21)00098-3 · PMID 34146515
  5. Xie Q, Walker HE, Minczuk M, Chiaratti MR, Chinnery PF (2026). Inheritance and selection of the mitochondrial genome. Nat Rev Genet (online ahead of print). doi:10.1038/s41576-026-01019-0 · PMID 42834120
  6. Floros VI, Pyle A, Dietmann S, et al. (2018). Segregation of mitochondrial DNA heteroplasmy through a developmental genetic bottleneck in human embryos. Nat Cell Biol 20:144–151. doi:10.1038/s41556-017-0017-8 · PMID 29335530
  7. Gupta R, Kanai M, Durham TJ, et al. (2023). Nuclear genetic control of mtDNA copy number and heteroplasmy in humans. Nature 620:839–848. doi:10.1038/s41586-023-06426-5 · PMID 37587338
  8. Mavraki E, Labrum R, Sergeant K, et al. (2023). Genetic testing for mitochondrial disease: the United Kingdom best practice guidelines. Eur J Hum Genet 31:148–163. doi:10.1038/s41431-022-01249-w · PMID 36513735
  9. Stewart JB, Chinnery PF (2015). The dynamics of mitochondrial DNA heteroplasmy: implications for human health and disease. Nat Rev Genet 16:530–542. doi:10.1038/nrg3966 · PMID 26281784
  10. Smeets HJM, Sallevelt SCEH, Herbert M (2023). Reproductive options in mitochondrial disease. Handb Clin Neurol 194:207–228. doi:10.1016/B978-0-12-821751-1.00004-X · PMID 36813314
  11. Gorman GS, Chinnery PF, DiMauro S, et al. (2016). Mitochondrial diseases. Nat Rev Dis Primers 2:16080. doi:10.1038/nrdp.2016.80 · PMID 27775730
  12. Gorman GS, Schaefer AM, Ng Y, et al. (2015). Prevalence of nuclear and mitochondrial DNA mutations related to adult mitochondrial disease. Ann Neurol 77:753–759. doi:10.1002/ana.24362 · PMID 25652200
  13. Rubens P, Mayeur A, Chatzovoulou K, et al. (2025). Profiling mitochondrial DNA variant segregation during human preimplantation development: a prerequisite to preimplantation genetic testing for mitochondrial DNA-related disorders. Hum Reprod 40:956–961. doi:10.1093/humrep/deaf050 · PMID 40174913
  14. Facucho-Oliveira JM, St John JC (2009). The relationship between pluripotency and mitochondrial DNA proliferation during early embryo development and embryonic stem cell differentiation. Stem Cell Rev Rep 5:140–158. doi:10.1007/s12015-009-9058-0 · PMID 19521804
  15. Luo S, Valencia CA, Zhang J, et al. (2018). Biparental Inheritance of Mitochondrial DNA in Humans. Proc Natl Acad Sci USA 115:13039–13044. doi:10.1073/pnas.1810946115 · PMID 30478036
  16. Iliushchenko D, Efimenko B, Mikhailova AG, et al. (2025). Deciphering the Foundations of Mitochondrial Mutational Spectra: Replication-Driven and Damage-Induced Signatures Across Chordate Classes. Mol Biol Evol 42(2):msae261. doi:10.1093/molbev/msae261 · PMID 39903101
  17. Bi C, Wang L, Fan Y, et al. (2023). Quantitative haplotype-resolved analysis of mitochondrial DNA heteroplasmy in human single oocytes, blastoids, and pluripotent stem cells. Nucleic Acids Res 51:3793–3805. doi:10.1093/nar/gkad209 · PMID 37014011
  18. Arbeithuber B, Anthony K, Higgins B, et al. (2025). Allele frequency selection and no age-related increase in human oocyte mitochondrial mutations. Sci Adv 11:eadw4954. doi:10.1126/sciadv.adw4954 · PMID 40768572
  19. Mertens J, Regin M, De Munck N, et al. (2022). Mitochondrial DNA variants segregate during human preimplantation development into genetically different cell lineages that are maintained postnatally. Hum Mol Genet 31:3629–3642. doi:10.1093/hmg/ddac059 · PMID 35285472
  20. Monnot S, Gigarel N, Samuels DC, et al. (2011). Segregation of mtDNA throughout human embryofetal development: m.3243A>G as a model system. Hum Mutat 32:116–125. doi:10.1002/humu.21417 · PMID 21120938
  21. Castelluccio N, Spath K, Li D, et al. (2025). Genetic and reproductive strategies to prevent mitochondrial diseases. Hum Reprod Update 31:269–306. doi:10.1093/humupd/dmaf004 · PMID 40085924
  22. Burr SP, Chinnery PF (2024). Origins of tissue and cell-type specificity in mitochondrial DNA (mtDNA) disease. Hum Mol Genet 33(R1):R3–R11. doi:10.1093/hmg/ddae059 · PMID 38779777