第1章 · PGT-mt基础知识
线粒体DNA与母系遗传
线粒体具有自身的环状DNA——线粒体DNA(mtDNA)。许多细胞含数百至数千个此类分子,数量取决于细胞类型。人类仅从母亲继承mtDNA:女性可将其传递给所有子女,男性不向子女传递。致病性变异(突变)可能仅存在于细胞内部分mtDNA分子中,第2章将解释这一点。这些特征使mtDNA相关疾病不遵循孟德尔遗传规律。
基础
线粒体内的基因组
人类大多数基因位于细胞核。每个核基因通常有两份拷贝,分别来自父母。线粒体具有自身DNA,并帮助细胞供能。人类mtDNA呈环状,约含16,600个碱基对(Anderson et al., 1981; Andrews et al., 1999)。尽管很小,它编码参与细胞供能的一些关键蛋白(Chinnery et al., 2000)。
核基因也编码线粒体功能所需蛋白。线粒体功能障碍导致的疾病可涉及核DNA或mtDNA突变。核DNA突变的遗传通常用经典遗传学描述,而mtDNA突变需要采用不同的分析方法(Ng et al., 2021)。
数百至数千份拷贝,而非两份
细胞含数百至数千份mtDNA拷贝,而非两份,数量随细胞类型而变:精子中数十份,成熟卵母细胞中数十万至逾百万份。一项研究测得三名健康供者卵母细胞平均约含120万个分子(Xie et al., 2026; Floros et al., 2018)。mtDNA拷贝数随组织、发育阶段而变,也部分取决于核遗传背景(Gupta et al., 2023)。
经母亲遗传
人类mtDNA经卵母细胞沿母系传递(Chinnery et al., 2000; Xie et al., 2026)。这带来一些简单而重要的遗传特点:携带mtDNA致病性变异的男性不会将其传给子女;女性可传给所有子女,不分性别,但只有女儿能继续传给下一代(Mavraki et al., 2023)。
同质性与异质性
细胞内全部mtDNA拷贝在所考察位点具有相同序列,称为同质性。不同类型mtDNA在细胞内共存,例如部分携带某变异、部分不携带,称为异质性。携带变异的比例称为异质性水平,也称突变负荷,以百分比表示(Stewart & Chinnery, 2015)。下方“细胞中的异质性”模型展示20%或80%的实际含义。
PGT-mt评估的大多数致病性变异呈异质性状态:携带及不携带变异的拷贝共存于同一细胞,包括卵母细胞。儿童可能同时继承这两类mtDNA拷贝。结局可从不发病到严重疾病,取决于变异及其异质性水平(Chinnery et al., 2000)。
这与核DNA基因遗传有何不同?
- 核DNA突变:一个基因通常有两份拷贝,分别来自父母。突变可发生在母源、父源或两份拷贝中;遗传遵循经典孟德尔模式。
- 线粒体DNA突变:沿母系遗传。每个细胞含多个mtDNA分子,携带突变的比例可从零至100%。无法预先预测某个卵母细胞的确切比例(Smeets et al., 2023)。
线粒体病的遗传学
线粒体病的表现及发病年龄差异很大。有时mtDNA突变不引起临床症状(Gorman et al., 2016)。约每200人中1人携带mtDNA致病性变异,通常水平较低;mtDNA疾病约影响每5,000–10,000人中的1人(Xie et al., 2026)。大多数携带者水平低于出现临床表现的阈值(第2章)。成年人约1/5,000的估计包含患者及有mtDNA疾病风险的携带者(Gorman et al., 2015)。mtDNA突变可新发,也可来自母亲。新发突变的再发风险通常较低,但不能完全排除其他卵母细胞也携带的可能(Smeets et al., 2023)。
PGT-mt测量从胚胎取得的少量活检样本中携带突变的mtDNA比例。该比例用于移植胚胎选择时的定量评估;基础课程将对此解释。
进阶
基因组结构
人类mtDNA参考序列(修订版剑桥参考序列,rCRS)长16,569 bp(Anderson et al., 1981; Andrews et al., 1999)。基因排列紧密,基因间碱基很少或没有;某些终止密码子未完整编码于DNA中,转录后经多聚腺苷酸化补全(Anderson et al., 1981)。主要非编码区约1 kb,含D环,具有调控复制与转录的元件(Chinnery et al., 2000)。其高变区如HV2具有多态性,可作为胚胎mtDNA分离研究的中性标记(Rubens et al., 2025)。
mtDNA编码的13种蛋白是呼吸链复合体I、III、IV、V的亚基;复合体II完全由核基因编码(Gorman et al., 2016)。变异按参考序列位置命名:m.3243A>G表示第3243位腺嘌呤被鸟嘌呤替代。图谱栏目中的变异位于tRNA基因(MT-TL1:m.3243A>G、m.3250T>C;MT-TK:m.8344A>G)及蛋白编码基因(MT-ATP6:m.8993T>G/C;MT-ND1:m.3697G>A;MT-ND3:m.10191T>C、m.10197G>A;MT-ND6:m.14487T>C)。
mtDNA拷贝数:数量而非常数
mtDNA拷贝数在组织与个体间不同,并与核基因组变异相关:人群规模分析发现与拷贝数及异质性均相关的核基因座(Gupta et al., 2023)。Floros等测得三名健康供者卵母细胞平均含1.22×10⁶个mtDNA分子;人胚Carnegie CS12阶段原始生殖细胞约少1,000倍(每细胞中位数1,425、均值1,446份);线粒体数量几乎不变,约每个细胞器五个分子(Floros et al., 2018)。小鼠、牛及斑马鱼也有类似生殖系拷贝数减少,具有进化保守性(Xie et al., 2026)。早期胚胎在囊胚阶段前mtDNA复制大体受抑,已有分子分配到不断增加的细胞中(Rubens et al., 2025; Facucho-Oliveira & St John, 2009)。
拷贝数与异质性是不同量。拷贝数描述mtDNA有多少,异质性描述各mtDNA变异的相对比例。
母系遗传
严格母系传递是人类及大多数动物的规律。Luo等报告三个家庭存在双亲遗传(Luo et al., 2018)。这些观测的解释仍有讨论,包括核基因组中mtDNA片段拷贝(NUMTs)的作用;阻止父系传递的机制仍在研究(Xie et al., 2026)。母系传递意味着mtDNA不与父源拷贝重组,以单一单倍型传递;新变异可来自复制错误、单链mtDNA损伤及氧化过程(Iliushchenko et al., 2025)。这些错误或由修复机制纠正,或跨代传播(Stewart & Chinnery, 2015)。mtDNA碱基替换的积累速度比核基因快10–20倍(Xie et al., 2026; Bi et al., 2023),但女性生殖系似乎受到保护:与血液及唾液不同,卵母细胞新突变频率未随年龄增加(Arbeithuber et al., 2025)。生殖系选择见第3章。
异质性:实践中重要的定义
- 异质性水平
- 分析样本中某位点携带变异分子占全部mtDNA分子的比例。它是样本全部细胞的平均值:多细胞活检样本会将异质性水平不同的细胞合并测量。
- 同质性
- 全部mtDNA拷贝在所考察位点序列相同。
- 细胞间嵌合
- 同一组织不同细胞的水平差异。即使第3天胚胎,单个卵裂球也可能携带邻近细胞未检出的变异(Mertens et al., 2022)。但该研究涉及无已知致病突变的供者胚胎中的自然变异,多为低水平。对于携带者的致病性变异,同一胚胎各卵裂球的异质性水平通常相近(第4章)(Mertens et al., 2022; Monnot et al., 2011)。
- 低水平异质性
- 低于常规方法检出限的罕见变异广泛存在,包括健康女性卵母细胞中(Bi et al., 2023)。
线粒体病的遗传特点
- 变异类型。mtDNA致病性变异通常呈异质性状态,也可呈同质性状态。PGT-mt适用于异质性:若全部卵母细胞变异比例相同,便无较低水平胚胎可选,需考虑其他生育方案(Smeets et al., 2023; Castelluccio et al., 2025)。
- 来源。后续子女疾病再发概率直接取决于突变来源:新发变异在后续同胞中再次导致疾病的风险较低,但不能完全排除其他母源卵母细胞也携带。若由母亲遗传,再发风险较大,却因瓶颈效应而无法预测单次妊娠(第3章)(Smeets et al., 2023)。因此讨论PGT-mt前,应研究母亲组织,并尽可能研究其他母系亲属组织(Mavraki et al., 2023)。
- 外显不全与表现度可变。同一变异可在不同携带者中引起不同综合征,从单一症状到严重多系统疾病;严重程度取决于特定组织突变负荷。例如m.8993T>G的临床表现随异质性水平不同(Gorman et al., 2016; Burr & Chinnery, 2024; Xie et al., 2026)。
- 核基因。核基因引起的线粒体病遵循孟德尔遗传,采用PGT-M而非PGT-mt(Smeets et al., 2023)。
考虑妊娠的女性已确认以异质性状态携带特定mtDNA致病性变异时,PGT-mt适用;最好在多种组织中得到确认。
图解与模型
细胞中的异质性
30%
100个mtDNA分子中,30个携带致病性变异
异质性:两种mtDNA共存于细胞内
- 野生型mtDNA
- 携带致病性变异的mtDNA
含细胞核及五个线粒体的细胞;圆环为mtDNA分子。
从概念到图谱数据
本章参考文献 (22)
全部DOI已与PubMed核对;例外在条目旁标注。
- (1981). Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nature 290:457–465. doi:10.1038/290457a0 · PMID 7219534
- (1999). Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA. Nat Genet 23:147. doi:10.1038/13779 · PMID 10508508
- (2000). The inheritance of mitochondrial DNA heteroplasmy: random drift, selection or both?. Trends Genet 16:500–505. doi:10.1016/S0168-9525(00)02120-X · PMID 11074292
- (2021). Mitochondrial disease in adults: recent advances and future promise. Lancet Neurol 20:573–584. doi:10.1016/S1474-4422(21)00098-3 · PMID 34146515
- (2026). Inheritance and selection of the mitochondrial genome. Nat Rev Genet (online ahead of print). doi:10.1038/s41576-026-01019-0 · PMID 42834120
- (2018). Segregation of mitochondrial DNA heteroplasmy through a developmental genetic bottleneck in human embryos. Nat Cell Biol 20:144–151. doi:10.1038/s41556-017-0017-8 · PMID 29335530
- (2023). Nuclear genetic control of mtDNA copy number and heteroplasmy in humans. Nature 620:839–848. doi:10.1038/s41586-023-06426-5 · PMID 37587338
- (2023). Genetic testing for mitochondrial disease: the United Kingdom best practice guidelines. Eur J Hum Genet 31:148–163. doi:10.1038/s41431-022-01249-w · PMID 36513735
- (2015). The dynamics of mitochondrial DNA heteroplasmy: implications for human health and disease. Nat Rev Genet 16:530–542. doi:10.1038/nrg3966 · PMID 26281784
- (2023). Reproductive options in mitochondrial disease. Handb Clin Neurol 194:207–228. doi:10.1016/B978-0-12-821751-1.00004-X · PMID 36813314
- (2016). Mitochondrial diseases. Nat Rev Dis Primers 2:16080. doi:10.1038/nrdp.2016.80 · PMID 27775730
- (2015). Prevalence of nuclear and mitochondrial DNA mutations related to adult mitochondrial disease. Ann Neurol 77:753–759. doi:10.1002/ana.24362 · PMID 25652200
- (2025). Profiling mitochondrial DNA variant segregation during human preimplantation development: a prerequisite to preimplantation genetic testing for mitochondrial DNA-related disorders. Hum Reprod 40:956–961. doi:10.1093/humrep/deaf050 · PMID 40174913
- (2009). The relationship between pluripotency and mitochondrial DNA proliferation during early embryo development and embryonic stem cell differentiation. Stem Cell Rev Rep 5:140–158. doi:10.1007/s12015-009-9058-0 · PMID 19521804
- (2018). Biparental Inheritance of Mitochondrial DNA in Humans. Proc Natl Acad Sci USA 115:13039–13044. doi:10.1073/pnas.1810946115 · PMID 30478036
- (2025). Deciphering the Foundations of Mitochondrial Mutational Spectra: Replication-Driven and Damage-Induced Signatures Across Chordate Classes. Mol Biol Evol 42(2):msae261. doi:10.1093/molbev/msae261 · PMID 39903101
- (2023). Quantitative haplotype-resolved analysis of mitochondrial DNA heteroplasmy in human single oocytes, blastoids, and pluripotent stem cells. Nucleic Acids Res 51:3793–3805. doi:10.1093/nar/gkad209 · PMID 37014011
- (2025). Allele frequency selection and no age-related increase in human oocyte mitochondrial mutations. Sci Adv 11:eadw4954. doi:10.1126/sciadv.adw4954 · PMID 40768572
- (2022). Mitochondrial DNA variants segregate during human preimplantation development into genetically different cell lineages that are maintained postnatally. Hum Mol Genet 31:3629–3642. doi:10.1093/hmg/ddac059 · PMID 35285472
- (2011). Segregation of mtDNA throughout human embryofetal development: m.3243A>G as a model system. Hum Mutat 32:116–125. doi:10.1002/humu.21417 · PMID 21120938
- (2025). Genetic and reproductive strategies to prevent mitochondrial diseases. Hum Reprod Update 31:269–306. doi:10.1093/humupd/dmaf004 · PMID 40085924
- (2024). Origins of tissue and cell-type specificity in mitochondrial DNA (mtDNA) disease. Hum Mol Genet 33(R1):R3–R11. doi:10.1093/hmg/ddae059 · PMID 38779777